НЕФКО управляет двумя углеродными фондами, располагающими совместно порядка 150 млн. евро. Представляя государственных и частных инвесторов, фонды готовят и обеспечивают выполнение проектов в странах Восточной Европы, Азии и Латинской Америки.

Углеродный фонд НЕФКО (NeCF) представляет собой международный углеродный фонд, созданный на принципах государственно-частного партнёрства. Начал свою деятельность в апреле 2008 года в качестве управляемого НЕФКО целевого доверительного фонда осуществления закупок сокращения выбросов парниковых газов в рамках механизмов совместного осуществления и чистого развития Киотского протокола. Капитал фонда составляет 115.3 млн. евро.

Углеродный фонд НЕФКО инвестирует в проекты различных секторов экономики, связанных с развитием возобновляемых источников энергии, энергосбережением, переходом на альтернативные виды топлива и др. Работа ведётся прежде всего в Российской Федерации, на Украине, в Китайской Народной Республике, Юго-Восточной Азии и Индии; однако, могут рассматриваться и другие страны.

Углеродный фонд Балтийского региона TGF – это региональный углеродный фонд, располагающий 35 млн. евро, который в рамках Киотского протокола закупает от имени своих инвесторов углеродные квоты (единицы установленного количества и единицы сокращения выбросов) проектов, связанных с энергетикой и другими промышленными секторами. Структура фонда отражает государственно-частное партнёрство, объединяя правительства, частные энергетические и промышленные предприятия региона Балтийского моря. Доверительное управление фондом осуществляет Северная экологическая финансовая корпорация (НЕФКО) – международная финансовая организация, принадлежащая правительствам пяти Северных стран. Головной офис НЕФКО находится в Хельсинки.